Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms