Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SynmQ70IV5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynmQ70IV5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms