Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms