Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RfflQ6ZQM0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RfflQ6ZQM0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms