Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup188Q6ZQH8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup188Q6ZQH8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms