Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80Q6ZPV2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80Q6ZPV2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80Q6ZPV2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80Q6ZPV2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80Q6ZPV2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms