Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms