Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm2lQ6PDS0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms