Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trak1Q6PD31 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms