Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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