Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms