Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gga2Q6P5E6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms