Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casc4Q6P2L7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms