Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slx4Q6P1D7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slx4Q6P1D7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms