Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SphkapQ6NSW3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SphkapQ6NSW3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms