Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc66Q6NS45 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc66Q6NS45 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms