Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms