Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop58Q6DFW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms