Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msl2Q69ZF8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msl2Q69ZF8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms