Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn4Q69Z26 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms