Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CilpQ66K08 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CilpQ66K08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms