Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpgs2Q66JT5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms