Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrmQ64674 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrmQ64674 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrmQ64674 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrmQ64674 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms