Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc3Q64519 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc3Q64519 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms