Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ptpn13Q64512 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn13Q64512 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ptpn13Q64512 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn13Q64512 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn13Q64512 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn13Q64512 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn13Q64512 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ptpn13Q64512 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ptpn13Q64512 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ptpn13Q64512 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ptpn13Q64512 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn13Q64512 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms