Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2bQ64511 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms