Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PtprdQ64487 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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