Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms