Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms