Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lcn3Q62471 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Lcn3Q62471 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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