Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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AtmQ62388 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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