Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms