Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm38Q62176 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm38Q62176 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm38Q62176 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm38Q62176 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm38Q62176 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm38Q62176 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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