Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctr9Q62018 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms