Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PcolceQ61398 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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