Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tfap2bQ61313 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms