Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna2Q61301 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms