Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hif1aQ61221 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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