Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nab1Q61122 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nab1Q61122 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Nab1Q61122 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nab1Q61122 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms