Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms