Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DbpQ60925 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DbpQ60925 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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