Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms