Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1h2Q60644 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms