Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tdrd5Q5VCS6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tdrd5Q5VCS6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms