Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl6Q5U3K5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms