Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc42Q5SV66 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms