Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col27a1Q5QNQ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col27a1Q5QNQ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms