Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3558Q5FWC9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3558Q5FWC9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3558Q5FWC9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3558Q5FWC9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3558Q5FWC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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