Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp22Q5DU02 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp22Q5DU02 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms