Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Rtl5Q5DTT4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtl5Q5DTT4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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